Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP4Q13115 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP4Q13115 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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