Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms