Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

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Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 TRM732YMR259C 4263 nt2.03□□□□□ -2.09
WSC3Q12215 VPS13YLL040C 9435 nt2.02□□□□□ -2.09
WSC3Q12215 MYO4YAL029C 4416 nt2□□□□□ -2.09
WSC3Q12215 LAA1YJL207C 6045 nt1.98□□□□□ -2.09
WSC3Q12215 FAB1YFR019W 6837 nt1.97□□□□□ -2.09
WSC3Q12215 SOV1YMR066W 2697 nt1.96□□□□□ -2.1
WSC3Q12215 TOR2YKL203C 7425 nt1.95□□□□□ -2.1
WSC3Q12215 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.95□□□□□ -2.1
WSC3Q12215 YPR117WYPR117W 7470 nt1.94□□□□□ -2.1
WSC3Q12215 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.94□□□□□ -2.1
WSC3Q12215 DNF1YER166W 4716 nt1.93□□□□□ -2.1
WSC3Q12215 VAM6YDL077C 3150 nt1.91□□□□□ -2.1
WSC3Q12215 USO1YDL058W 5373 nt1.9□□□□□ -2.1
WSC3Q12215 YGR130CYGR130C 2451 nt1.9□□□□□ -2.11
WSC3Q12215 BST1YFL025C 3090 nt1.89□□□□□ -2.11
WSC3Q12215 CDC39YCR093W 6327 nt1.88□□□□□ -2.11
WSC3Q12215 SPP41YDR464W 4308 nt1.86□□□□□ -2.11
WSC3Q12215 SSK2YNR031C 4740 nt1.84□□□□□ -2.11
WSC3Q12215 FKS1YLR342W 5631 nt1.84□□□□□ -2.11
WSC3Q12215 SBH2YER019C-A 267 nt1.84□□□□□ -2.11
WSC3Q12215 FIG2YCR089W 4830 nt1.83□□□□□ -2.12
WSC3Q12215 MON2YNL297C 4911 nt1.83□□□□□ -2.12
WSC3Q12215 TMA7YLR262C-A 195 nt1.82□□□□□ -2.12
WSC3Q12215 DNF3YMR162C 4971 nt1.77□□□□□ -2.13
WSC3Q12215 YOR093CYOR093C 4947 nt1.76□□□□□ -2.13
WSC3Q12215 PEP1YBL017C 4740 nt1.74□□□□□ -2.13
WSC3Q12215 PMD1YER132C 5262 nt1.73□□□□□ -2.13
WSC3Q12215 BPH1YCR032W 6504 nt1.72□□□□□ -2.13
WSC3Q12215 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt1.72□□□□□ -2.13
WSC3Q12215 YJL113WYJL113W 4647 nt1.7□□□□□ -2.14
WSC3Q12215 MYO1YHR023W 5787 nt1.69□□□□□ -2.14
WSC3Q12215 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.68□□□□□ -2.14
WSC3Q12215 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.67□□□□□ -2.14
WSC3Q12215 BUD3YCL014W 4911 nt1.66□□□□□ -2.14
WSC3Q12215 YJR029WYJR029W 5268 nt1.65□□□□□ -2.15
WSC3Q12215 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.65□□□□□ -2.15
WSC3Q12215 YMR045CYMR045C 5268 nt1.64□□□□□ -2.15
WSC3Q12215 MEC1YBR136W 7107 nt1.61□□□□□ -2.15
WSC3Q12215 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.6□□□□□ -2.15
WSC3Q12215 LTE1YAL024C 4308 nt1.59□□□□□ -2.15
WSC3Q12215 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.57□□□□□ -2.16
WSC3Q12215 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.55□□□□□ -2.16
WSC3Q12215 VPS15YBR097W 4365 nt1.52□□□□□ -2.17
WSC3Q12215 HKR1YDR420W 5409 nt1.51□□□□□ -2.17
WSC3Q12215 YOL014WYOL014W 375 nt1.5□□□□□ -2.17
WSC3Q12215 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.49□□□□□ -2.17
WSC3Q12215 RPL41BYDL133C-A 78 nt1.47□□□□□ -2.17
WSC3Q12215 IRA1YBR140C 9279 nt1.42□□□□□ -2.18
WSC3Q12215 SCC2YDR180W 4482 nt1.41□□□□□ -2.18
WSC3Q12215 BRR2YER172C 6492 nt1.39□□□□□ -2.19
WSC3Q12215 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.38□□□□□ -2.19
WSC3Q12215 RKR1YMR247C 4689 nt1.36□□□□□ -2.19
WSC3Q12215 IQG1YPL242C 4488 nt1.34□□□□□ -2.19
WSC3Q12215 ESP1YGR098C 4893 nt1.34□□□□□ -2.19
WSC3Q12215 PAU24YBR301W 363 nt1.33□□□□□ -2.2
WSC3Q12215 THO2YNL139C 4794 nt1.33□□□□□ -2.2
WSC3Q12215 FMP27YLR454W 7887 nt1.32□□□□□ -2.2
WSC3Q12215 snR58snR58 96 nt1.32□□□□□ -2.2
WSC3Q12215 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.31□□□□□ -2.2
WSC3Q12215 BEM2YER155C 6504 nt1.3□□□□□ -2.2
WSC3Q12215 CCH1YGR217W 6120 nt1.27□□□□□ -2.21
WSC3Q12215 MLP1YKR095W 5628 nt1.27□□□□□ -2.21
WSC3Q12215 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt1.24□□□□□ -2.21
WSC3Q12215 DOP1YDR141C 5097 nt1.24□□□□□ -2.21
WSC3Q12215 IML1YJR138W 4755 nt1.23□□□□□ -2.21
WSC3Q12215 snR6snR6 112 nt1.19□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.18□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.18□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.18□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.18□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.18□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.18□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.18□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.16□□□□□ -2.22
WSC3Q12215 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.14□□□□□ -2.23
WSC3Q12215 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.14□□□□□ -2.23
WSC3Q12215 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt1.01□□□□□ -2.25
WSC3Q12215 PAU9YBL108C-A 129 nt1.01□□□□□ -2.25
WSC3Q12215 UTP20YBL004W 7482 nt1.01□□□□□ -2.25
WSC3Q12215 snR73snR73 106 nt0.98□□□□□ -2.25
WSC3Q12215 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
WSC3Q12215 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
WSC3Q12215 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
WSC3Q12215 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
WSC3Q12215 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
WSC3Q12215 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.87□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.87□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.87□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 snR161snR161 161 nt0.84□□□□□ -2.27
WSC3Q12215 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.78□□□□□ -2.28
WSC3Q12215 snR128snR128 126 nt0.77□□□□□ -2.29
WSC3Q12215 UTP10YJL109C 5310 nt0.76□□□□□ -2.29
WSC3Q12215 URB1YKL014C 5295 nt0.71□□□□□ -2.3
WSC3Q12215 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
WSC3Q12215 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.6□□□□□ -2.31
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