Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN12Q05209 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms