Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMX1Q04741 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms