Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APBA1Q02410 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms