Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTUD4Q01804 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms