Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAP1Q01518 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAP1Q01518 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms