Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms