Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms