Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms