Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX3P78415 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX3P78415 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX3P78415 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX3P78415 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms