Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX6P78412 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX6P78412 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX6P78412 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX6P78412 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX6P78412 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX6P78412 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX6P78412 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX6P78412 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX6P78412 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX6P78412 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX6P78412 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX6P78412 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX6P78412 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX6P78412 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX6P78412 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX6P78412 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX6P78412 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX6P78412 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms