Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IP78347 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms