Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms