Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXW4P57775 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms