Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSDMDP57764 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GSDMDP57764 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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