Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX10P56693 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX10P56693 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX10P56693 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX10P56693 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX10P56693 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX10P56693 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms