Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME5P56597 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME5P56597 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME5P56597 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME5P56597 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME5P56597 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME5P56597 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME5P56597 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME5P56597 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME5P56597 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NME5P56597 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms