Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms