Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M2P53677 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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