Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP98P52948 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP98P52948 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP98P52948 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP98P52948 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP98P52948 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP98P52948 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP98P52948 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms