Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms