Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DAP3P51398 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DAP3P51398 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DAP3P51398 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms