Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCAMP50895 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCAMP50895 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCAMP50895 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCAMP50895 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCAMP50895 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCAMP50895 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCAMP50895 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms