Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATMP50440 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATMP50440 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATMP50440 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATMP50440 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATMP50440 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GATMP50440 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GATMP50440 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATMP50440 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GATMP50440 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATMP50440 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATMP50440 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATMP50440 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATMP50440 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATMP50440 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms