Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms