Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPAP49450 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPAP49450 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPAP49450 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPAP49450 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPAP49450 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPAP49450 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPAP49450 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPAP49450 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPAP49450 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPAP49450 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPAP49450 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPAP49450 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms