Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCLMP48507 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCLMP48507 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCLMP48507 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCLMP48507 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLMP48507 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLMP48507 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms