Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms