Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL29P47914 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL29P47914 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL29P47914 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL29P47914 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL29P47914 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL29P47914 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL29P47914 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL29P47914 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL29P47914 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL29P47914 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL29P47914 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL29P47914 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms