Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPZBP47756 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZBP47756 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms