Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRCC3P46736 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms