Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRXP46100 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRXP46100 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms