Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPARGP37231 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPARGP37231 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPARGP37231 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PPARGP37231 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPARGP37231 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPARGP37231 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPARGP37231 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPARGP37231 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPARGP37231 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPARGP37231 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPARGP37231 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPARGP37231 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PPARGP37231 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PPARGP37231 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms