Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYH11P35749 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYH11P35749 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYH11P35749 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYH11P35749 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms