Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
THBS4P35443 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
THBS4P35443 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
THBS4P35443 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
THBS4P35443 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
THBS4P35443 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
THBS4P35443 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
THBS4P35443 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
THBS4P35443 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
THBS4P35443 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
THBS4P35443 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
THBS4P35443 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
THBS4P35443 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
THBS4P35443 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
THBS4P35443 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
THBS4P35443 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms