Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNNB1P35222 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNB1P35222 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms