Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSG3P32926 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSG3P32926 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms