Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms