Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD40LGP29965 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms