Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRMP28827 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
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