Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms