Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGB2P26583 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms