Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA3P26006 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms