Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

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Length 2,201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNCP24821 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNCP24821 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNCP24821 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNCP24821 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNCP24821 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNCP24821 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNCP24821 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNCP24821 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNCP24821 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNCP24821 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNCP24821 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNCP24821 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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