Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP1P23763 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms