Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK11BP21127 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms