Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD247P20963 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD247P20963 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD247P20963 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD247P20963 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD247P20963 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms