Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NTF3P20783 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NTF3P20783 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms